军队一旦断粮，军心开始不稳。僧格林沁抓住机会，到处散发免死牌，只要拿着牌子投降者都免死。面对清军的诱惑，少部分在河南、安徽等地招募的新兵开始陆续投降，其中奸细施绍恒还把林凤祥和李开芳联络暗号告诉僧王。

结果林凤祥见到暗号，以为李开芳来援，被骗出城遭到僧王重兵伏击，又损失很多兄弟。

在这样艰苦的环境下，太平军没有吃的就吃树皮，草根，甚至吃清军的尸体，又硬抗了三个月。

这期间僧格林沁不断的让投降者冲在最前面，做炮灰。后来见效果不大，知道已经到了这个时候，愿意投降的也都投降了，这些人没利用价值了，一口气把这几百名投降过来的叛军全部杀掉。

林凤祥带着最后两千名弹尽粮绝的老兄弟与数万清军拼死搏斗，无奈寡不敌众，所有人战斗到最后一刻，一半人死于清军刀枪之下，一半人投运河自尽。

林凤祥深受重伤，无法动弹，被属下藏在地窖中，躲过了三天。最后还是被挖地三尺的清军找到，僧格林沁不愿抓个死人，派军医救治，为他续命。然后放入囚车送到京城，咸丰皇帝下令凌迟处死。

林凤祥行刑时神态自若，刽子手用刀刮他的肉，他都没有呻吟一声，也没有畏惧之色，更没有一句求饶的话，直至皮肉割尽，鲜血流干，不亏是太平天国的一条好汉。

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另一方面，李开芳看到谭绍光等人后，明白了林凤祥的意思，要为西王为北伐军留种子。他也让谭绍光带自己军中两三百名十八岁以下的孩子离开，南下去天京。然后转过身继续和围攻他的胜保战斗。

这胜保耍嘴皮子行，打仗远远不如僧格林沁，数万步骑兵拿李开芳的千余人没有办法，几个月怎么都攻不进高唐。每天都写些不存在的胜利，糊弄咸丰帝。

连镇的林凤祥覆灭后，朝廷有了比较，把毫无进展的胜保狠狠训斥一番，撤了他钦差的职，让僧王接管他的队伍，继续攻打高唐。

僧格林沁还是用老办法，引水来灌溉。不过这里的水不太好引，离运河比较远。但僧王不管，他发动数万民夫，整整挖了一个多月，终于引水成功。

又经过一个多月的反复进攻，弹尽粮绝的李开芳终于抵挡不住，最后只剩下八十余人，被僧格林沁生擒。

他的结局和林凤祥一样，打入囚车，送去京城，凌迟处死。太平军以后重要的将领被俘，结局都是凌迟处死，可见清廷对太平天国恨之入骨。

北伐军在北方坚持了这么长的时间，可以说他们是尽了自己最大的力量与清军周旋，最后全军覆灭不能全怪林李两人。

北方寒冷的气候南方人很难适应，华北大平原不利于步兵为主的太平军野外战斗，北方靠近皇城，语言难以交流，群众基础薄弱，无法得到足够的补充支援。天时、地利、人和都不在太平军，再加上人数又只有两万多人，还没有一名有领导力的元帅统一指挥，这是一场必败的战役。

这之前的中国历史上从南打到北，最后胜利的，也只有明朝开国皇帝朱元璋一人。